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Caracterización molecular y morfológica de aislamientos del hongo Mycena citricolor colectados en diferentes zonas cafetaleras de Costa Rica

by López Arguedas, Alex; CATIE, Turrialba (Costa Rica).
Publisher: Turrialba (Costa Rica) 2001Description: 91 p.Other Title: Molecular and morphologic characterization of isolations of M. citricolor fungus in coffee zones of Costa Rica.Subject(s): MYCENA CITRICOLOR | ENFERMEDADES FUNGOSAS | BIOLOGIA MOLECULAR | AISLAMIENTO | VARIACION GENETICA | MARCADORES GENETICOS | COSTA RICA | FUNGAL DISEASES | MOLECULAR BIOLOGY | ISOLATION | GENETIC VARIATION | GENETIC MARKERS | COSTA RICA | MALADIE FONGIQUE | BIOLOGIE MOLECULAIRE | ISOLEMENT | VARIATION GENETIQUE | MARQUEUR GENETIQUE | COSTA RICAOnline Resources: Texto completo (Es) Summary: El cultivo del café representa una de las mayores fuentes de divisas para la región Centroamericana. Durante el periodo 1997-1998 la producción de café en Centro América alcanzó los 11.9 millones de sacos; ocupando la tercera posición en cuanto a producción en el mundo. La producción de este cultivo se concentra en manos de pequeños agricultores y es una fuente importante de generación de empleo (IICA, 1998 y 1999). Mycena citricolor conocida comunmente como ojo de gallo, es una de las enfermedades de mayor importancia en el cultivo del café en Costa Rica. Se estima que de las 110,000 hectáreas de café sembradas, entre 10 y 15 por ciento están afectadas por ojo de gallo. Un cálculo conservador elaborado por el Departamento de Protección de cultivos del Ministerio de Agricultura y Ganadería (MAG), estimó que anualmente esta enfermedad deja pérdidas por 10 millones de dólares a la caficultura nacional (Vargas, 2000). Existe poca investigación disponible sobre la biología del patógeno. Por lo tanto, sería muy útil conocer la variabilidad genética del patógeno para establecer un mejor control del mismo. Esta investigación tuvo como objetivos principales: agrupar mediante análisis molecular y morfológico la diversidad genética del hongo Mycena citricolor en zonas cafetaleras de Costa Rica y determinar el nivel de variabilidad genética mediante el estudio molecular y morfofisiológico de 26 aislamientos. En la caracterización molecular se utilizó medio mineral para producir micelio de calidad y se aplicó el procedimiento MATAB en la extracción de ADN. Además, se utilizó marcadores RAPD y por medio de una matriz de distancias genética, se determinó el nivel de variabilidad de 26 aislamientos de M. citricolor. Además, se elaboró un dendograma que agrupó los aislamientos en cuatro grupos de acuerdo a su distancia genética, con una tendencia de agrupación de acuerdo a su origen geográfico. Se identificó 81 bandas polimórficas a partir de 17 "primers", de los cuales 14 bandas aportaron el mayor valor significativo para diferenciar entre los grupos. La caracterización morfológica estubo constituida por variables cuantitativas y cualitativas, siendo el diámetro de la colonia, presencia-ausencia de gema y pedicelo, color de las gemas y el patrón de crecimiento in vitro las que permitieron establecer diferencias entre los aislamientos. Se utilizó la tabla de colores Munsell para diferenciar el color de las gemas en los 26 aislamientos, identificándose 5 valores cromáticos: 2.5 Y(8/6), 2.5 Y(812), 5Y(8/8), 5Y (8/10), 5Y(8/12). También, se identificó 6 diferentes patrones de crecimiento. Finalmente se comparó los grupos genéticos obtenidos con datos metereológicos de Costa Rica, siendo la variable brillo solar la que mayor relación presentó con el análisis molecular. Cada una de las herramientas en el presente estudio permitió caracterizar a 26 aislamientos de Mycena citricolor y de esta forma conocer más acerca del comportamiento de este patógeno.
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Location Collection Call number Status Date due
BCO
GRAL Available
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12 ilus. 6 tab. 6 mapas. Bib. p. 61-68

Tesis (M. Sc) -- CATIE, Turrialba (Costa Rica), 2001

El cultivo del café representa una de las mayores fuentes de divisas para la región Centroamericana. Durante el periodo 1997-1998 la producción de café en Centro América alcanzó los 11.9 millones de sacos; ocupando la tercera posición en cuanto a producción en el mundo. La producción de este cultivo se concentra en manos de pequeños agricultores y es una fuente importante de generación de empleo (IICA, 1998 y 1999). Mycena citricolor conocida comunmente como ojo de gallo, es una de las enfermedades de mayor importancia en el cultivo del café en Costa Rica. Se estima que de las 110,000 hectáreas de café sembradas, entre 10 y 15 por ciento están afectadas por ojo de gallo. Un cálculo conservador elaborado por el Departamento de Protección de cultivos del Ministerio de Agricultura y Ganadería (MAG), estimó que anualmente esta enfermedad deja pérdidas por 10 millones de dólares a la caficultura nacional (Vargas, 2000). Existe poca investigación disponible sobre la biología del patógeno. Por lo tanto, sería muy útil conocer la variabilidad genética del patógeno para establecer un mejor control del mismo. Esta investigación tuvo como objetivos principales: agrupar mediante análisis molecular y morfológico la diversidad genética del hongo Mycena citricolor en zonas cafetaleras de Costa Rica y determinar el nivel de variabilidad genética mediante el estudio molecular y morfofisiológico de 26 aislamientos. En la caracterización molecular se utilizó medio mineral para producir micelio de calidad y se aplicó el procedimiento MATAB en la extracción de ADN. Además, se utilizó marcadores RAPD y por medio de una matriz de distancias genética, se determinó el nivel de variabilidad de 26 aislamientos de M. citricolor. Además, se elaboró un dendograma que agrupó los aislamientos en cuatro grupos de acuerdo a su distancia genética, con una tendencia de agrupación de acuerdo a su origen geográfico. Se identificó 81 bandas polimórficas a partir de 17 "primers", de los cuales 14 bandas aportaron el mayor valor significativo para diferenciar entre los grupos. La caracterización morfológica estubo constituida por variables cuantitativas y cualitativas, siendo el diámetro de la colonia, presencia-ausencia de gema y pedicelo, color de las gemas y el patrón de crecimiento in vitro las que permitieron establecer diferencias entre los aislamientos. Se utilizó la tabla de colores Munsell para diferenciar el color de las gemas en los 26 aislamientos, identificándose 5 valores cromáticos: 2.5 Y(8/6), 2.5 Y(812), 5Y(8/8), 5Y (8/10), 5Y(8/12). También, se identificó 6 diferentes patrones de crecimiento. Finalmente se comparó los grupos genéticos obtenidos con datos metereológicos de Costa Rica, siendo la variable brillo solar la que mayor relación presentó con el análisis molecular. Cada una de las herramientas en el presente estudio permitió caracterizar a 26 aislamientos de Mycena citricolor y de esta forma conocer más acerca del comportamiento de este patógeno.

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